На нашем хостинге невозможно использовать директиву SetHandler cgi-script. В этом случае ваши скрипты будут запускаться от пользователя nobody и работать не будут.
Когда поступает запрос на считывание web-страницы, web-сервер сначала анализирует .htaccess файл. Сервер ищет .htaccess в корневой web-директории, а затем начинает спускаться по дереву директорий, пока не дойдет до директории, где находится запрашиваемая страница.